U těchto druhů se skrývají vedle oportunních spouštěčů nemoci (enteropatogenní a enterohemoragické E. coli) také reprezentanti, kteří jsou nepatogenní a ve zvláštní míře imunomodulují. V lidském střevu nacházíme colibakterie v rozmezí od 10x 5 - 10 x 7 na gram faeces (od 0,0001 do 0,001 % celkové flóry). Jejich zvláštní důleži-tost spočívá v aktivaci lidských imunitních buněk ( přirozených zabíječských buněk, makrofágů, CD4-T-buněk, CD8-T-buněk, B-buněk).Je za to zodpovědný především lipid A - součást lipopolysacharidu (LPS). Jsou to bakteriální struktury v pouzdru (obalu) bakterie.Vyšetření ukázala, že s povrchovými strukturami bakterií bude imunitní systém na buněčné straně pozitivně reagovat. Regulační mechanizmus v oblasti T-buněk byl popsán v literatuře.
Specifickému vzhledu struktury stěny buněk se přisuzuje mnoho pozitivních ůčinků imunitního systému:

1.Posiluje obranyschopnost proti vniklým bakteriím ( translokace).
2.Potlačuje schopnost adheze virů
3.Povzbuzuje funkci makrofágů včetně přitomných antigenů.
4.Potlačuje zánětlivé stimuly.
5.Snižuje imunitní aktivitu při endotoxinovém šoku.
6.Minimalizuje hnisavé efekty.
7.Brání růstu tumorů prostřednictvím stimulace TNF a jiných cytokininů.

U coli- autovakcíny se především ukazují signifikantní přeměny interleukinů , které jsou v souladu s klinickými nálezy.

Použití: K léčebným účelům se používají jak celé bakterie, tak také části buněčných stěn ve formě suspenze nebo suché biomasy v kapslích. Autovakcíny obsahují kompletní buňky. Účinek těchto léčivých prostředků byl potrzen v mnoha studiích. Tak se ukázalo, že escherichia coli je ekvivalentní k mesalazinu při ošetřování ulcerózní kolitidy a může být použita. Kromě efektu stabilizace vnitřního prostředí přispívá při léčení také imunoregulativním procesem, který je založen na těsném spojení tlustého střeva s lymfatickou tkání. Další velkou oblastí použití je dráždivý tračník.
Jako monoterapii můžeme E. coli bakterie použít u následujících diagnóz:

- zánětlivé kožní nemoci ( umrtvené colibakterie)
- průjmová onemocnění
- chronické zánětlivé střevní nemoci

Kromě toho budou tyto produkty úspěšně vkládány do léčebného plánu, jak je naznačeno na léčebném schématu AMT.

E.coli autovakcíny

Autovakcíny využívají k léčbě střevní bakterie pro jejich předpokládaný imunoregu-lační účinek. Používají se fyziologické, nepatogenní, netoxické bakterie ( zpravidla E.coli).V rámci mikrobiologické terapie můžeme podle dnešních znalostí využít následujících vlastností E. coli:

1.imunomodulační aktivace prostřednictvím makrofágů
2.regulace rovnováhy T-H-1 a T-H-2 pomahačských buněk
3.účinek žírných buněk prostřednictvím sekrece defensinu