V souvislosti s výsledkem vývoje alergických reakcí se dostává střevní flóra stále více do popředí pozornosti vědeckých výzkumů.Aktuální vyšetřování živých střevních sliznic ukazují, že žírné buňky v mukóze lidí, kteří trpí na potravní alergie, zvýšeně produkují histamin.To se děje jak spontánně, tak také na úrovni specifických antigenů. Bakteriální součásti buněčné stěny, jako jsou lipopolysacharidy, peptido-glykany nebo fibriny, ale také složitý clostridiový toxin A a určité kmeny E. Coli, umožňují degranulaci mastocytů. Stejně tak budou žírné buňky aktivovány bakteriemi přes komplementový systém.Bakterie jsou podle nových poznatků v prostoru, kde ovlivňují jak histaminová vlákna v tkáni ( Histidindecarboxylase – Expression), tak také aktivují histamin rozkládající enzymy (Diaminoxidáza, Histamin -N-Methyltrans-feráza). Některá probiotika indukují tvorbu defensinu. Poslední jsou endogenní kultivované kationové peptidy, které umožňují, že mohou růst histamin produkují bakteriální kmeny. Defensiny se podstatně podílejí na obraně tím, že narušenou slizniční plochu alergicky reagujících pacientů opět vedou ke stabilizaci.