Chronické infekty gastrointestinálního a respiračního traktu a stejně tak i neinfekční nemoci a poruchy gastrointestinálního traktu

Prostřednictvím perorálního podávání probiotik se dostávají antigeny do subepiteliálních vrstev střevní sliznice. Tam dochází k migraci lymfocytů, které se v mezenteriálních lymfatických uzlinách rozdělují a přes ductus thoracikus a krevním oběhem se nakonec dostávají do mukózy respiračního, urogenitálního a gastrointestinálního traktu. Poté tady dochází k obnovenému kontaktu s antigeny a k tvorbě protilátek.
Vedle aktivace lymfocytů dochází v subepiteliální vrstvě k aktivaci fygocytů a také k uvolnění cytokinů, což vede k všeobecnému zvýšení obranného výkonu.